La Facultad de Ciencias Naturales de la Universidad de Puerto Rico, Recinto de Río Piedras es en la actualidad una de las más destacadas en su campo y uno de los centros de investigación más importantes del país.  Sus inicios se remontan al 1943, cuando bajo la dirección de su primer Decano, el Dr. Facundo Bueso (1943-1959), quedó establecida al haberse dividido la que hasta ese momento fue la Facultad de Artes y Ciencias como el Colegio de Ciencias Naturales con programas estrictamente sub-graduados.  Ese proyecto inicial constituido por los departamentos de Matemáticas, Química, Biología y Física fue evolucionando hasta convertirse ocho décadas después en una facultad de vanguardia integrada por seis departamentos: Matemáticas, Química, Biología, Física, Ciencias Ambientales y Ciencia de Cómputos (cinco de éstos con programas sub-graduados y graduados de maestría y/o doctorales), un programa de Bachillerato en Nutrición y Dietética y el Programa Interdisciplinario en Ciencias Naturales.

Su trayectoria a nivel graduado inició en 1960 con la Maestría en Ciencias y Artes.  Más adelante, se le sumaron los programas doctorales de Química (1970), Física-Química (1983), Matemáticas (2002) y Ciencias Ambientales (2010).

En enero del 1999, el emblema de la Facultad de Ciencias Naturales fue rediseñado. Para comenzar el proceso, se evaluó el emblema anterior, diseñando así dos emblemas de prueba, los cuales fueron presentados ante el profesorado. Eventualmente, se presentaron once emblemas de prueba ante el personal docente y no docente de la Facultad para que seleccionasen las tres mejores opciones.

Los tres emblemas fueron entonces presentados en una reunión de profesores, quienes pidieron que las ideas fuesen sometidas al Taller de Ilustración Científica para que se desarrollasen. Más adelante, el Dr. Rafael Joglar, del Departamento de Biología, sometió dos emblemas adicionales que fueron incluidos en la papeleta final para la votación. El emblema final fue creado por el ilustrador científico José M. Terrón y fue seleccionado en diciembre de 2001.

Descripción del emblema
El emblema representa a la torre icónica del Recinto. El color amarillo simboliza a la Facultad de Ciencias Naturales y el color rojo representa al Recinto de Río Piedras de la Universidad de Puerto Rico. Dentro de la torre, el acrónimo CN significa “Ciencias Naturales” y UPR significa “Universidad de Puerto Rico”. El globo terráqueo es símbolo de la internacionalización de las ciencias naturales.