El Programa Graduado en Química de la Universidad de Puerto Rico, Recinto de Río Piedras fue establecido en la década de 1960 con la creación de un ofrecimiento académico conducente al grado de Maestría en Química. Posteriormente, en 1970, se estableció el programa de Doctorado (Ph.D.) en Química, seguido en 1981 por el desarrollo de un programa colaborativo con el Departamento de Física, conducente al grado de Doctorado (Ph.D.) en Física Química.
En la actualidad, el Programa Graduado sirve a estudiantes de Puerto Rico y del extranjero, promoviendo un ambiente académico diverso que fomenta el intercambio intelectual, la colaboración interdisciplinaria y una sólida proyección académica global.